Anfänge
In der Saison 2010/11 war Thioune Co-Trainer von Arie van Lent beim Drittligisten Rot Weiss Ahlen, wurde jedoch nach der Insolvenz im Juni 2011 von seinen Aufgaben entbunden. In der Saison 2011/12 war er Scout beim FC Rot-Weiß Erfurt.Ab der Saison 2013/14 trainierte er die B1-Junioren (U17) des VfL Osnabrück und stieg mit dieser 2015 in die B-Junioren-Bundesliga (Staffel Nord/Nordost) auf. Als Joe Enochs 2015 Nachfolger von Maik Walpurgis als Cheftrainer der VfL-Profimannschaft wurde, übernahm Thioune von Enochs die sportliche Leitung der VfL-Nachwuchsabteilung und wurde Cheftrainer der A-Junioren (U19). Unter seiner Leitung schaffte die U19 im Jahr 2016 den Wiederaufstieg aus der A-Jugend-Regionalliga Nord in die A-Junioren-Bundesliga (Staffel Nord/Nordost). Im März 2016 erhielt Thioune die Fußballlehrer-Lizenz, den Lehrgang an der Hennes-Weisweiler-Akademie hatte er u. a. zusammen mit Julian Nagelsmann, Alexander Nouri und Domenico Tedesco absolviert.VfL Osnabrück
Nach einem schlechten Start in die Saison 2017/18 wurde Joe Enochs Anfang Oktober 2017 von seiner Aufgabe als Cheftrainer der Drittligamannschaft entbunden. Thioune übernahm zunächst als Interimstrainer; Anfang November 2017 erhielt er schließlich einen Vertrag als Cheftrainer. Unter Thioune erreichte die Mannschaft auf dem 17. Platz mit 6 Punkten Vorsprung den Klassenerhalt. In der Saison 2018/19 führte er den VfL zur Meisterschaft und damit zum Aufstieg in die 2. Bundesliga. Im September 2019 wurde sein Vertrag beim VfL bis Juni 2021 verlängert. In der Saison 2019/20 belegte Thiounes Mannschaft nach der Hinrunde mit 26 Punkten den 5. Platz, wobei der Rückstand auf einen direkten Aufstiegsplatz 4 Punkte betrug. In der Rückrunde waren die Osnabrücker mit 14 Punkten allerdings das schlechteste Team, wodurch man in den Abstiegskampf geriet. Der Klassenerhalt konnte am 33. Spieltag perfekt gemacht werden und der VfL schloss die Saison als bester Aufsteiger mit 40 Punkten auf dem 13. Platz ab.Hamburger SV
Zur Saison 2020/21 übernahm Thioune die Zweitligamannschaft des Hamburger SV, die zuvor auf dem 4. Platz zum zweiten Mal in Folge den Wiederaufstieg in die Bundesliga verpasst hatte. Er folgte auf Dieter Hecking, dessen Vertrag ausgelaufen war und unter dem er beim VfB Lübeck gespielt hatte. Thioune nutzte eine Ausstiegsklausel in seinem Vertrag beim VfL Osnabrück und unterschrieb beim HSV bis zum 30. Juni 2022. Der HSV schied in Thiounes erstem Pflichtspiel im DFB-Pokal gegen den Drittligisten Dynamo Dresden aus. In die Liga startete man allerdings mit 5 Siegen in Folge. Nach einer anschließenden Sieglosserie von 5 Spielen, von denen 3 Spiele in Folge verloren gingen, stabilisierte sich die Mannschaft ab dem 11. Spieltag wieder und musste bis zum Ende der Halbserie nur noch einen Punktverlust durch ein Unentschieden hinnehmen. Die Hinrunde, die aufgrund des späten Saisonstarts erst im Januar 2021 endete, schloss man somit mit 36 Punkten als Tabellenführer ab. In der Rückrunde brachen die Leistungen des HSV wie in den beiden Vorjahren ein. Der HSV blieb ab dem 20. Spieltag erneut 5 Spiele in Folge sieglos. Nach 2 siegreichen Spielen folgte ab dem 27. Spieltag erneut eine Sieglosserie von 5 Spielen, während der man u. a. nach einer 3:0-Führung gegen Hannover 96 noch 3:3 spielte oder gegen den Abstiegskandidaten SV Sandhausen verlor. Aufgrund dieser Entwicklung wurde Thioune Anfang Mai 2021 freigestellt und für die letzten 3 Spiele durch den Nachwuchsdirektor Horst Hrubesch ersetzt. Der HSV stand zu diesem Zeitpunkt mit 52 Punkten auf dem 3. Platz, wobei der Rückstand auf einen direkten Aufstiegsplatz 5 Punkte betrug. Der Vorsprung auf Holstein Kiel betrug 2 Punkte, jedoch hatten die Kieler aufgrund einer Mannschaftsquarantäne 3 Spiele weniger absolviert. Der HSV beendete die Saison auf dem 4. Rang. Fortuna Düsseldorf
Am 8. Februar 2022 wurde Thioune Cheftrainer des Zweitligisten Fortuna Düsseldorf. Er unterschrieb einen Vertrag bis zum 30. Juni 2023 und folgte auf Christian Preußer. Die Mannschaft stand zu diesem Zeitpunkt nach dem 21. Spieltag der Saison 2021/22 mit 20 Punkten auf dem Abstiegsrelegationsplatz, wobei der Rückstand auf einen Nicht-Abstiegsplatz 3 und der Vorsprung auf einen Abstiegsplatz 5 Punkte betrug. Die ersten zwölf Spiele unter Thioune blieb die Mannschaft ungeschlagen und belegte zu Saisonende mit 44 Punkten den 10. Tabellenplatz. Nach der guten Rückrunde und da der Kader größtenteils zusammengehalten wurde, galt die Fortuna zur Saison 2022/23 als Kandidat für die Aufstiegsplätze und erreichte letztlich Platz 4. Im Januar 2023 verlängerte Thioune seinen Vertrag bis zum 30. Juni 2025. In der Saison 2023/24 führte Thioune die Düsseldorfer auf den 3. Platz. In der Relegation traf man auf den VfL Bochum. Nach einem 3:0-Auswärtssieg im Hinspiel verlor die Fortuna das Rückspiel mit 0:3 und scheiterte im anschließenden Elfmeterschießen am Aufstieg in die Bundesliga. |
