| Stand: 28.05.2023 / Ende der Saison 2022-2023 |
| Hinweis: Die Tabelle wurde nach dem Drei-Punkte-System errechnet. 2008/09 wurden den Stuttgarter Kickers 3 Punkte, 2010/11 Rot Weiss Ahlen 3 Punkte, 2012/13 Alemannia Aachen 5 Punkte und den Offenbacher Kickers 2 Punkte, 2014/15 Spvgg Unterhaching 2 Punkte, 2016/17 VfR Aalen und FSV Frankfurt jeweils 9 Punkte, 2017/18 Rot-Weiß Erfurt 10 Punkte und dem Chemnitzer FC 9 Punkte, 2020/21 KFC Uerdingen 3 Punkte abgezogen. 2021/22 wurden alle Spiele mit Beteiligung von Türkgücü München annulliert. |
| # | Verein | Spiele | S | U | V | +/- | Punkte | |
| 1 |   | SV Wehen Wiesbaden | 494 | 198 | 132 | 162 | 85 | 726 |
| 2 |  | VfL Osnabrück | 418 | 181 | 112 | 123 | 109 | 655 |
| 3 |  | FC Hansa Rostock | 380 | 148 | 108 | 124 | 34 | 552 |
| 4 |  | Hallescher FC | 418 | 142 | 117 | 157 | -36 | 543 |
| 5 |  | SpVgg Unterhaching | 418 | 140 | 106 | 172 | -53 | 524 |
| 6 |  | Rot-Weiß Erfurt | 380 | 130 | 98 | 152 | -56 | 478 |
| 7 |  | Preußen Münster | 342 | 125 | 98 | 119 | 29 | 473 |
| 8 |  | SG Dynamo Dresden | 266 | 126 | 65 | 75 | 108 | 443 |
| 9 |  | Chemnitzer FC | 304 | 107 | 79 | 118 | -5 | 391 |
| 10 |  | MSV Duisburg | 266 | 103 | 75 | 86 | 19 | 384 |
| 11 |  | 1.FC Magdeburg | 226 | 105 | 63 | 58 | 115 | 378 |
| 12 |  | 1.FC Saarbrücken | 266 | 100 | 71 | 93 | 31 | 371 |
| 13 |  | VfB Stuttgart II | 304 | 96 | 81 | 127 | -39 | 369 |
| 14 |  | Eintracht Braunschweig | 226 | 101 | 62 | 63 | 102 | 365 |
| 15 |  | SSV Jahn Regensburg | 266 | 89 | 80 | 97 | -20 | 347 |
| 16 |  | FSV Zwickau | 265 | 84 | 74 | 106 | -54 | 326 |
| 17 |  | 1.FC Heidenheim 1846 | 190 | 91 | 48 | 51 | 79 | 321 |
| 18 |  | VfR Aalen | 266 | 78 | 92 | 96 | -41 | 317 |
| 19 |  | FC Carl Zeiss Jena | 266 | 76 | 77 | 113 | -111 | 305 |
| 20 |  | TSV 1860 München | 190 | 79 | 52 | 57 | 65 | 289 |
| 21 |  | SV Meppen | 227 | 77 | 57 | 92 | -49 | 288 |
| 22 |  | Würzburger Kickers | 188 | 75 | 51 | 62 | 22 | 276 |
| 23 |  | SG Sonnenhof Großaspach | 228 | 69 | 68 | 91 | -50 | 275 |
| 24 |  | SV Wacker Burghausen | 228 | 68 | 64 | 96 | -75 | 268 |
| 25 |  | Holstein Kiel | 190 | 67 | 64 | 59 | 40 | 265 |
| 26 |  | SV Werder Bremen II | 266 | 64 | 72 | 130 | -131 | 264 |
| 27 |  | Kickers Offenbach | 190 | 69 | 58 | 63 | 37 | 263 |
| 28 |  | Borussia Dortmund II | 228 | 67 | 58 | 101 | -51 | 259 |
| 29 |  | FC Ingolstadt 04 | 152 | 69 | 38 | 45 | 61 | 245 |
| 30 |  | FC Bayern München II | 190 | 63 | 56 | 71 | -13 | 245 |
| 31 |  | SC Fortuna Köln | 190 | 62 | 48 | 80 | -65 | 234 |
| 32 |  | FC Erzgebirge Aue | 152 | 63 | 42 | 47 | 24 | 231 |
| 33 |  | SV Waldhof Mannheim | 152 | 61 | 45 | 44 | 16 | 228 |
| 34 |  | Stuttgarter Kickers | 190 | 59 | 54 | 77 | -43 | 228 |
| 35 |  | Karlsruher SC | 114 | 62 | 33 | 19 | 88 | 219 |
| 36 |  | 1.FC Kaiserslautern | 150 | 53 | 53 | 44 | 27 | 212 |
| 37 |  | SV Sandhausen | 152 | 53 | 50 | 49 | 9 | 209 |
| 38 |  | FC Viktoria Köln | 151 | 53 | 43 | 54 | -21 | 202 |
| 39 |  | Arminia Bielefeld | 114 | 56 | 32 | 26 | 55 | 200 |
| 40 |  | SC Paderborn 07 | 114 | 57 | 24 | 33 | 68 | 195 |
| 41 |  | SV Darmstadt 98 | 114 | 41 | 36 | 37 | 19 | 159 |
| 42 |  | SC Verl | 114 | 37 | 33 | 42 | 3 | 144 |
| 43 |  | FC Energie Cottbus | 114 | 36 | 34 | 44 | -27 | 142 |
| 44 |  | KFC Uerdingen 05 | 114 | 37 | 29 | 48 | -41 | 137 |
| 45 |  | 1.FSV Mainz 05 II | 114 | 33 | 31 | 50 | -25 | 130 |
| 46 |  | Sportfreunde Lotte | 114 | 33 | 29 | 52 | -33 | 128 |
| 47 |  | SV Babelsberg 03 | 114 | 32 | 31 | 51 | -45 | 127 |
| 48 |  | SC Freiburg II | 76 | 33 | 21 | 20 | 12 | 120 |
| 49 |  | SV 07 Elversberg | 76 | 32 | 18 | 26 | 18 | 114 |
| 50 |  | Wuppertaler SV | 76 | 21 | 20 | 35 | -30 | 83 |
| 51 |  | RasenBallsport Leipzig | 38 | 24 | 7 | 7 | 31 | 79 |
| 52 |  | 1.FC Union Berlin | 38 | 22 | 12 | 4 | 36 | 78 |
| 53 |  | Fortuna Düsseldorf | 38 | 20 | 9 | 9 | 21 | 69 |
| 54 |  | Kickers Emden | 38 | 16 | 11 | 11 | 1 | 59 |
| 55 |  | TuS Koblenz | 38 | 13 | 10 | 15 | -8 | 49 |
| 56 |  | Türkgücü München | 38 | 12 | 11 | 15 | -10 | 47 |
| 57 |  | Rot-Weiss Essen | 38 | 9 | 15 | 14 | -13 | 42 |
| 58 |  | Rot Weiss Ahlen | 38 | 11 | 9 | 18 | -24 | 39 |
| 59 |  | Rot-Weiß Oberhausen | 38 | 8 | 14 | 16 | -14 | 38 |
| 60 |  | FC Viktoria 1889 Berlin | 36 | 10 | 7 | 19 | -18 | 37 |
| 61 |  | VfB Lübeck | 38 | 8 | 11 | 19 | -16 | 35 |
| 62 |  | VfB Oldenburg | 38 | 9 | 8 | 21 | -22 | 35 |
| 63 |  | SpVgg Bayreuth | 38 | 9 | 5 | 24 | -42 | 32 |
| 64 |  | Alemannia Aachen | 38 | 7 | 10 | 21 | -28 | 29 |
| 65 |  | FSV Frankfurt | 38 | 7 | 13 | 18 | -12 | 25 |
| 66 |  | TSV Havelse | 36 | 5 | 8 | 23 | -43 | 23 |
