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| # | Spieler | Land | Mannschaft | Tore (11m) |
| 1. | Christian Eigler | Deutschland | SpVgg Greuther Fürth | 18 (1) |
| 2. | Giovanni Federico | Italien | Karlsruher SC | 14 (0) |
| Marek Krejci | Slowakei | Wacker Burghausen | 14 (0) | |
| 4. | Régis Dorn | Frankreich | Kickers Offenbach | 13 (0) |
| Marius Ebbers | Deutschland | Alemannia Aachen | 13 (0) | |
| 6. | Edu | Brasilien | VfL Bochum | 12 (3) |
| Sergiu Radu | Rumänien | Energie Cottbus | 12 (0) | |
| 8. | Zvjezdan Misimović | Bosnien-Herzegowina | VfL Bochum | 11 (1) |
| René Müller | Deutschland | SC Paderborn 07 | 11 (0) | |
| Jan Schlaudraff | Deutschland | Alemannia Aachen | 11 (0) | |
| Suat Türker | Türkei | Kickers Offenbach | 11 (2) | |
| 12. | Paul Agostino | Australien | TSV 1860 München | 9 (0) |
| Momo Diabang | Sénégal | Kickers Offenbach, VfL Bochum | 9 (1) | |
| Kevin McKenna | Kanada | Energie Cottbus | 9 (0) | |
| Marcel Ndjeng | Kamerun | SC Paderborn 07 | 9 (0) | |
| Marcel von Walsleben-Schied | Deutschland | Hansa Rostock | 9 (0) | |
| 17. | Henrich Benčík | Slowakei | 1. FC Saarbrücken | 8 (0) |
| Patrick Bick | Deutschland | Eintracht Braunschweig | 8 (3) | |
| Dragan Bogavac | Montenegro | Wacker Burghausen | 8 (1) | |
| Andrzej Juskowiak | Polen | Erzgebirge Aue | 8 (0) | |
| Enrico Kern | Deutschland | Hansa Rostock | 8 (0) | |
| Francis Kioyo | Deutschland | Energie Cottbus | 8 (0) | |
| Nico Patschinski | Deutschland | LR Ahlen | 8 (1) | |
| Sascha Rösler | Deutschland | Alemannia Aachen | 8 (0) | |
| Christoph Teinert | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 8 (0) | |
| 26. | Soumaila Coulibaly | Mali | SC Freiburg | 7 (2) |
| Sebastian Freis | Deutschland | Karlsruher SC | 7 (0) | |
| Danny Fuchs | Deutschland | SpVgg Greuther Fürth | 7 (0) | |
| Joshua Kennedy | Australien | Dynamo Dresden | 7 (0) | |
| Ahmet Kuru | Türkei | Eintracht Braunschweig | 7 (0) | |
| 31. | Chadli Amri | Algerien | 1. FC Saarbrücken | 6 (0) |
| Roda Antar | Libanon | SC Freiburg | 6 (0) | |
| Dennis Aogo | Deutschland | SC Freiburg | 6 (6) | |
| Musemestre Bamba | Kongo | LR Ahlen | 6 (2) | |
| Stefan Buck | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 6 (2) | |
| Sean Dundee | Deutschland | Karlsruher SC | 6 (2) | |
| Daniel Graf | Deutschland | Eintracht Braunschweig | 6 (0) | |
| Edmond Kapllani | Albanien | Karlsruher SC | 6 (0) | |
| Michal Kolomazník | Tschechien | TSV 1860 München | 6 (0) | |
| Sven Lintjens | Deutschland | Sportfreunde Siegen | 6 (0) | |
| Yilmaz Örtülü | Deutschland | 1. FC Saarbrücken | 6 (0) | |
| Laurentiu Reghecampf | Rumänien | Alemannia Aachen | 6 (2) | |
| Christian Timm | Deutschland | SpVgg Greuther Fürth | 6 (0) | |
| Joris Van Hout | Belgien | VfL Bochum | 6 (0) | |
| Marco Vorbeck | Deutschland | Dynamo Dresden | 6 (0) | |
| 46. | Hans Andreasen | Dänemark | SpVgg Greuther Fürth | 5 (0) |
| Necat Aygün | Türkei | SpVgg Unterhaching | 5 (0) | |
| Till Bettenstaedt | Deutschland | Sportfreunde Siegen | 5 (0) | |
| Cafú | Portugal | Sportfreunde Siegen | 5 (0) | |
| Ersin Demir | Türkei | Erzgebirge Aue | 5 (0) | |
| Jonathan Jäger | Frankreich | 1. FC Saarbrücken | 5 (0) | |
| Samuel Koejoe | Niederlande | SC Freiburg | 5 (0) | |
| Matthias Lehmann | Deutschland | TSV 1860 München | 5 (2) | |
| Erik Meijer | Niederlande | Alemannia Aachen | 5 (0) | |
| Babacar N'Diaye | Sénégal | SpVgg Unterhaching | 5 (0) | |
| Jürgen Rische | Deutschland | Eintracht Braunschweig | 5 (0) | |
| Danny Schwarz | Deutschland | Karlsruher SC | 5 (0) | |
| Daniel Thioune | Deutschland | LR Ahlen | 5 (0) | |
| 59. | Magnus Arvidsson | Schweden | Hansa Rostock | 4 (0) |
| Tommy Bechmann | Dänemark | VfL Bochum | 4 (0) | |
| Thomas Bröker | Deutschland | Dynamo Dresden | 4 (0) | |
| Thorsten Burkhardt | Deutschland | Wacker Burghausen | 4 (0) | |
| Hüzeyfe Dogan | Deutschland | SC Paderborn 07 | 4 (0) | |
| Christian Fröhlich | Deutschland | Dynamo Dresden | 4 (1) | |
| Lars Fuchs | Deutschland | Eintracht Braunschweig | 4 (0) | |
| Mustapha Hadji | Marokko | 1. FC Saarbrücken | 4 (0) | |
| Nico Herzig | Deutschland | Wacker Burghausen | 4 (0) | |
| Aleksandr Iashvili | Georgien | SC Freiburg | 4 (0) | |
| Lars Jungnickel | Deutschland | Energie Cottbus | 4 (0) | |
| Tomáš Klinka | Tschechien | Erzgebirge Aue | 4 (0) | |
| Sebastian Kneißl | Deutschland | Wacker Burghausen | 4 (0) | |
| Ioannis Masmanidis | Deutschland | Karlsruher SC | 4 (0) | |
| Darlington Omodiagbe | Nigeria | SpVgg Unterhaching | 4 (0) | |
| Rade Prica | Schweden | Hansa Rostock | 4 (0) | |
| Sérgio da Silva Pinto | Deutschland | Alemannia Aachen | 4 (1) | |
| Jiayi Shao | China | TSV 1860 München | 4 (0) | |
| David Siradze | Georgien | Erzgebirge Aue | 4 (0) | |
| Vragel da Silva | Brasilien | Energie Cottbus | 4 (0) | |
| 79. | Gregg Berhalter | USA | Energie Cottbus | 3 (3) |
| Nils-Ole Book | Deutschland | LR Ahlen | 3 (0) | |
| Roel Brouwers | Niederlande | SC Paderborn 07 | 3 (0) | |
| Aïmen Demai | Tunesien | 1. FC Saarbrücken | 3 (0) | |
| Antonio di Salvo | Deutschland | Hansa Rostock | 3 (0) | |
| Jörg Emmerich | Deutschland | Erzgebirge Aue | 3 (2) | |
| Marco Gebhardt | Deutschland | TSV 1860 München | 3 (0) | |
| Patrick Ghigani | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 3 (0) | |
| Daniel Gunkel | Deutschland | Energie Cottbus | 3 (0) | |
| Roberto Hilbert | Deutschland | SpVgg Greuther Fürth | 3 (0) | |
| Torben Hoffmann | Deutschland | TSV 1860 München | 3 (0) | |
| Daniel Imhof | Kanada | VfL Bochum | 3 (0) | |
| Ranisav Jovanović | Serbien | LR Ahlen | 3 (0) | |
| Radosław Kałużny | Polen | LR Ahlen | 3 (0) | |
| Jiří Kaufman | Tschechien | Karlsruher SC | 3 (0) | |
| Alexander Klitzpera | Deutschland | Alemannia Aachen | 3 (0) | |
| Martin Meichelbeck | Deutschland | VfL Bochum | 3 (0) | |
| Andre Mijatović | Kroatien | SpVgg Greuther Fürth | 3 (0) | |
| Dennis Schulp | Niederlande | SC Paderborn 07 | 3 (0) | |
| Benjamin Schüßler | Deutschland | SC Paderborn 07 | 3 (0) | |
| Stephan Sieger | Deutschland | Kickers Offenbach | 3 (0) | |
| Mirosław Spizak | Polen | Sportfreunde Siegen | 3 (1) | |
| Hrvoje Vuković | Kroatien | Wacker Burghausen | 3 (0) | |
| 102. | Barbaros Barut | Türkei | SpVgg Greuther Fürth | 2 (2) |
| Daniel Bogusz | Polen | Sportfreunde Siegen | 2 (0) | |
| Markus Bollmann | Deutschland | SC Paderborn 07 | 2 (0) | |
| Kai Bülow | Deutschland | Hansa Rostock | 2 (0) | |
| Dennis Cagara | Philippinen | Dynamo Dresden | 2 (0) | |
| Bradley Carnell | Südafrika | Karlsruher SC | 2 (0) | |
| Harald Cerny | Österreich | TSV 1860 München | 2 (0) | |
| Skerdilaid Curri | Albanien | Erzgebirge Aue | 2 (0) | |
| Nils Döring | Deutschland | Sportfreunde Siegen | 2 (0) | |
| Mehmet Dragusha | Albanien | SC Paderborn 07 | 2 (0) | |
| Pavel Drsek | Tschechien | VfL Bochum | 2 (0) | |
| Ivan Dudić | Serbien | 1. FC Saarbrücken | 2 (0) | |
| Mario Eggimann | Schweiz | Karlsruher SC | 2 (0) | |
| Tomislav Erceg | Kroatien | SpVgg Greuther Fürth | 2 (0) | |
| Daniel Felgenhauer | Deutschland | SpVgg Greuther Fürth | 2 (0) | |
| Gledson | Brasilien | Hansa Rostock | 2 (0) | |
| Kevin Hampf | Deutschland | Erzgebirge Aue | 2 (0) | |
| Kevin Hansen | Deutschland | Hansa Rostock | 2 (0) | |
| Florian Heller | Deutschland | Erzgebirge Aue | 2 (0) | |
| Björn Hertl | Deutschland | Wacker Burghausen | 2 (0) | |
| Steffen Hofmann | Deutschland | TSV 1860 München | 2 (0) | |
| Markus Krösche | Deutschland | SC Paderborn 07 | 2 (0) | |
| Dennis Kruppke | Deutschland | SC Freiburg | 2 (0) | |
| Dexter Langen | Deutschland | Dynamo Dresden | 2 (0) | |
| Christian Lenze | Deutschland | Erzgebirge Aue | 2 (0) | |
| Stephan Maaß | Deutschland | SC Paderborn 07 | 2 (0) | |
| Marcel Maltritz | Deutschland | VfL Bochum | 2 (1) | |
| Karim Matmour | Algerien | SC Freiburg | 2 (0) | |
| Patrick Milchraum | Deutschland | TSV 1860 München | 2 (0) | |
| Oualid Mokhtari | Marokko | Kickers Offenbach | 2 (0) | |
| Andreas Nauroth | Deutschland | Sportfreunde Siegen | 2 (0) | |
| Peter Németh | Slowakei | Sportfreunde Siegen | 2 (0) | |
| Emil Noll | Deutschland | Alemannia Aachen | 2 (0) | |
| Paulinho | Brasilien | LR Ahlen | 2 (0) | |
| Timo Rost | Deutschland | Energie Cottbus | 2 (1) | |
| Carsten Rothenbach | Deutschland | Karlsruher SC | 2 (0) | |
| René Rydlewicz | Deutschland | Hansa Rostock | 2 (0) | |
| Wilfried Sanou | Burkina Faso | SC Freiburg | 2 (0) | |
| Tim Sebastian | Deutschland | Hansa Rostock | 2 (0) | |
| Thomas Stehle | Deutschland | Alemannia Aachen | 2 (0) | |
| Carsten Sträßer | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 2 (0) | |
| Goran Šukalo | Slowenien | Alemannia Aachen | 2 (1) | |
| Ibrahim Tanko | Ghana | SC Freiburg | 2 (0) | |
| Paul Thomik | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 2 (0) | |
| Ivo Ulich | Tschechien | Dynamo Dresden | 2 (0) | |
| Jan Velkoborský | Tschechien | LR Ahlen | 2 (0) | |
| Tomáš Votava | Tschechien | Dynamo Dresden | 2 (0) | |
| Nemanja Vučićević | Serbien | TSV 1860 München | 2 (0) | |
| Maik Wagefeld | Deutschland | Dynamo Dresden | 2 (0) | |
| Thomas Wörle | Deutschland | Kickers Offenbach | 2 (0) | |
| Thomas Zdebel | Polen | VfL Bochum | 2 (0) | |
| 153. | Silvio Adzic | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 1 (0) |
| Benedict Akwuegbu | Nigeria | Sportfreunde Siegen | 1 (0) | |
| Martin Amedick | Deutschland | Eintracht Braunschweig | 1 (0) | |
| Angelo Barletta | Italien | Sportfreunde Siegen | 1 (0) | |
| Mišo Brečko | Slowenien | Hansa Rostock | 1 (0) | |
| Ansgar Brinkmann | Deutschland | Dynamo Dresden | 1 (1) | |
| Daniel Brinkmann | Deutschland | SC Paderborn 07 | 1 (0) | |
| Florian Bruns | Deutschland | Alemannia Aachen | 1 (0) | |
| Albert Bunjaku | Kosovo | SC Paderborn 07 | 1 (0) | |
| Heiko Butscher | Deutschland | VfL Bochum | 1 (0) | |
| Đorđije Ćetković | Montenegro | Hansa Rostock | 1 (0) | |
| David Czyszczon | Deutschland | VfL Bochum | 1 (0) | |
| Garry De Graef | Belgien | SC Paderborn 07 | 1 (0) | |
| Richard Dostálek | Tschechien | Erzgebirge Aue | 1 (0) | |
| Markus Dworrak | Deutschland | Energie Cottbus | 1 (0) | |
| Petar Đenić | Serbien | LR Ahlen | 1 (0) | |
| Uwe Ehlers | Deutschland | Erzgebirge Aue | 1 (0) | |
| Fábio Júnior | Brasilien | VfL Bochum | 1 (0) | |
| Cristian Fiél | Deutschland | Alemannia Aachen | 1 (0) | |
| Oliver Fink | Deutschland | Wacker Burghausen | 1 (0) | |
| Nico Frommer | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 1 (0) | |
| Stefan Frühbeis | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 1 (0) | |
| Daniel Gómez | Frankreich | Energie Cottbus | 1 (0) | |
| Dennis Grote | Deutschland | VfL Bochum | 1 (0) | |
| Sven Günther | Deutschland | Erzgebirge Aue | 1 (0) | |
| Matthias Hagner | Deutschland | 1. FC Saarbrücken | 1 (0) | |
| Nazif Hajdarović | Bosnien-Herzegowina | 1. FC Saarbrücken | 1 (0) | |
| Niels Hansen | Deutschland | SC Freiburg | 1 (0) | |
| Lars Hermel | Deutschland | SC Freiburg | 1 (0) | |
| Finn Holsing | Deutschland | Eintracht Braunschweig | 1 (0) | |
| Christian Holzer | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 1 (0) | |
| Andreas Ibertsberger | Österreich | SC Freiburg | 1 (0) | |
| Thorsten Judt | Deutschland | Kickers Offenbach | 1 (0) | |
| Laszlo Kanyuk | Ungarn | Kickers Offenbach | 1 (0) | |
| Rafael Kazior | Deutschland | Wacker Burghausen | 1 (0) | |
| Thomas Kleine | Deutschland | SpVgg Greuther Fürth | 1 (0) | |
| Erwin Koen | Niederlande | Alemannia Aachen | 1 (0) | |
| Aleš Kokot | Slowenien | SpVgg Greuther Fürth | 1 (0) | |
| Marco Kurth | Deutschland | Erzgebirge Aue | 1 (0) | |
| Robert Lechleiter | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 1 (0) | |
| Alexander Ludwig | Deutschland | Dynamo Dresden | 1 (0) | |
| Jan Männer | Deutschland | Karlsruher SC | 1 (0) | |
| Gabriel Melkam | Nigeria | Sportfreunde Siegen | 1 (0) | |
| Remo Meyer | Schweiz | TSV 1860 München | 1 (0) | |
| Youssef Mohamad | Libanon | SC Freiburg | 1 (0) | |
| Michael Mutzel | Deutschland | Karlsruher SC | 1 (0) | |
| Timo Nagy | Deutschland | Wacker Burghausen | 1 (0) | |
| Kai Oswald | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 1 (0) | |
| Pavel Pergl | Tschechien | Dynamo Dresden | 1 (0) | |
| Jonathan Pitroipa | Burkina Faso | SC Freiburg | 1 (0) | |
| Reiner Plaßhenrich | Deutschland | Alemannia Aachen | 1 (0) | |
| Catalin Racanel | Rumänien | LR Ahlen | 1 (0) | |
| Tobias Rathgeb | Deutschland | Hansa Rostock | 1 (0) | |
| Giuseppe Reina | Deutschland | Sportfreunde Siegen | 1 (0) | |
| Rodrigo Costa | Brasilien | TSV 1860 München | 1 (0) | |
| Kosta Rodrigues | Deutschland | Eintracht Braunschweig | 1 (0) | |
| Marcel Rozgonyi | Deutschland | 1. FC Saarbrücken | 1 (0) | |
| Kenan Şahin | Türkei | Energie Cottbus | 1 (0) | |
| Marcel Schäfer | Deutschland | TSV 1860 München | 1 (0) | |
| Mitja Schäfer | Deutschland | LR Ahlen | 1 (0) | |
| Ronald Schmidt | Deutschland | Wacker Burghausen | 1 (1) | |
| Steffen Schmitt | Deutschland | Sportfreunde Siegen | 1 (0) | |
| Sebastian Schoof | Deutschland | SC Paderborn 07, Sportfreunde Siegen | 1 (0) | |
| Benjamin Siegert | Deutschland | Eintracht Braunschweig | 1 (0) | |
| Tomislav Stanic | Bosnien-Herzegowina | Dynamo Dresden | 1 (0) | |
| Marc Stein | Deutschland | Hansa Rostock | 1 (0) | |
| Martin Stoll | Deutschland | Karlsruher SC | 1 (0) | |
| René Trehkopf | Deutschland | Erzgebirge Aue | 1 (0) | |
| Filip Trojan | Tschechien | VfL Bochum | 1 (0) | |
| Witold Wawrzyczek | Polen | Dynamo Dresden | 1 (0) | |
| Björn Weikl | Deutschland | Sportfreunde Siegen | 1 (0) | |
| Lars Weißenfeldt | Deutschland | Kickers Offenbach | 1 (0) | |
| Michael Wiesinger | Deutschland | Wacker Burghausen | 1 (0) | |
| Dariusz Wosz | Deutschland | VfL Bochum | 1 (0) | |
| Daniel Ziebig | Deutschland | Energie Cottbus | 1 (0) |
Aufstieg zur Bundesliga 2006/073 direkte Aufsteiger in die Bundesliga. |
| Mannschaften | Ligen |
| VfL Bochum | Meister 2. Bundesliga 2005/06 |
| Alemannia Aachen | Zweiter 2. Bundesliga 2005/06 |
| Energie Cottbus | Dritter 2. Bundesliga 2005/06 |
Aufstieg zur 2. Bundesliga 2006/07Direktaufsteiger |
| Mannschaften | Ligen |
| Rot-Weiss Essen | Meister Regionalliga Nord |
| FC Carl Zeiss Jena | Vizemeister Regionalliga Nord |
| FC Augsburg | Meister Regionalliga Süd |
| TuS Koblenz | Vizemeister Regionalliga Süd |
