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| # | Spieler | Mannschaft | Tore (11m) |
| 1. | Michael Tönnies | MSV Duisburg | 29 (1) |
| 2. | Marcus Marin | Stuttgarter Kickers | 22 (3) |
| 3. | Thomas Adler | Blau-Weiß 90 Berlin | 21 (0) |
| 4. | Jochen Heisig | Hannover 96 | 18 (1) |
| 5. | Niels Schlotterbeck | SC Freiburg | 16 (3) |
| 6. | Holger Aden | Eintracht Braunschweig | 14 (0) |
| Dino Capocchiano | TSV Havelse | 14 (2) | |
| 8. | Aleksandr Borodyuk | FC Schalke 04 | 13 (0) |
| Henrik Eichenauer | SV Darmstadt 98 | 13 (0) | |
| Dimitrios Moutas | Stuttgarter Kickers | 13 (3) | |
| Jörg Wolff | Waldhof Mannheim | 13 (0) | |
| 12. | Holger Friz | Fortuna Köln | 12 (0) |
| Michael Preetz | 1. FC Saarbrücken | 12 (1) | |
| Mikhail Rusayev | VfB Oldenburg | 12 (0) | |
| Claus-Dieter Wollitz | VfL Osnabrück | 12 (2) | |
| 16. | Dieter Hecking | Waldhof Mannheim | 11 (2) |
| Thorsten Schlumberger | Blau-Weiß 90 Berlin | 11 (5) | |
| 18. | Ingo Anderbrügge | FC Schalke 04 | 10 (1) |
| Radek Drulák | VfB Oldenburg | 10 (2) | |
| Bernd Gries | FC 08 Homburg | 10 (0) | |
| Jürgen Klopp | 1. FSV Mainz 05 | 10 (0) | |
| Peter Sendscheid | FC Schalke 04 | 10 (0) | |
| Uwe Spies | SC Freiburg | 10 (0) | |
| 24. | Robert Thoben | SV Meppen | 9 (0) |
| 25. | Juan Cayasso | Stuttgarter Kickers | 8 (0) |
| René Deffke | Blau-Weiß 90 Berlin | 8 (0) | |
| Reiner Edelmann | Preußen Münster | 8 (0) | |
| Dirk Helmig | Rot-Weiss Essen | 8 (2) | |
| Norbert Hönnscheidt | 1. FSV Mainz 05 | 8 (0) | |
| Uwe Jursch | VfL Osnabrück | 8 (0) | |
| Carsten Linke | VfB Oldenburg | 8 (0) | |
| Josef Menke | SV Meppen | 8 (0) | |
| Günter Schlipper | FC Schalke 04 | 8 (1) | |
| Ferenc Schmidt | MSV Duisburg | 8 (0) | |
| Stephan Täuber | SV Darmstadt 98 | 8 (0) | |
| Ralf Vollmer | Stuttgarter Kickers | 8 (0) | |
| 37. | Christoph Hanses | SV Meppen | 7 (0) |
| Lutz Hofmann | Waldhof Mannheim | 7 (0) | |
| Vladimir Lyutiy | FC Schalke 04 | 7 (0) | |
| Gernot Ruof | 1. FSV Mainz 05 | 7 (0) | |
| Wolfgang Schüler | 1. FC Saarbrücken | 7 (0) | |
| Thomas Schweizer | SC Freiburg | 7 (0) | |
| Michael Struckmann | MSV Duisburg | 7 (0) | |
| 44. | Mario Basler | Rot-Weiss Essen | 6 (0) |
| Lars-Peter Beike | TSV Havelse | 6 (2) | |
| Thorsten Bolzek | Fortuna Köln | 6 (0) | |
| Bernd Buchheister | Eintracht Braunschweig | 6 (1) | |
| Gerd Dais | Waldhof Mannheim | 6 (2) | |
| Uwe Eckel | Hannover 96 | 6 (0) | |
| Patrick Grün | Hannover 96 | 6 (0) | |
| Daniel Jurgeleit | FC 08 Homburg | 6 (0) | |
| Fred Klaus | VfL Osnabrück | 6 (0) | |
| Ralf Regenbogen | Rot-Weiss Essen | 6 (0) | |
| Joachim Reuß | 1. FC Schweinfurt 05 | 6 (0) | |
| Thomas Seeliger | Eintracht Braunschweig | 6 (1) | |
| Jörg Wawrzyniak | VfB Oldenburg | 6 (0) | |
| 57. | Jonathan Akpoborie | 1. FC Saarbrücken | 5 (0) |
| Matthias Baranowski | 1. FC Schweinfurt 05, FC 08 Homburg | 5 (0) | |
| Michael Blättel | SV Darmstadt 98 | 5 (0) | |
| Andreas Brandts | Fortuna Köln | 5 (0) | |
| Dirk Bremser | MSV Duisburg | 5 (1) | |
| Ansgar Brinkmann | Preußen Münster, VfL Osnabrück | 5 (0) | |
| Lothar Dittmer | Waldhof Mannheim | 5 (0) | |
| Stefan Holze | Eintracht Braunschweig | 5 (0) | |
| Holger Janz | SC Freiburg | 5 (0) | |
| Andreas Keim | Stuttgarter Kickers | 5 (0) | |
| Thomas Kristl | 1. FC Saarbrücken | 5 (1) | |
| Michael Müller | 1. FSV Mainz 05 | 5 (1) | |
| Viktor Pasulko | Fortuna Köln | 5 (0) | |
| Jürgen Serr | Rot-Weiss Essen | 5 (0) | |
| Thomas Ziemer | FC 08 Homburg | 5 (0) | |
| 72. | Dirk Bakalorz | SV Darmstadt 98 | 4 (0) |
| Rodolfo Cardoso | FC 08 Homburg | 4 (0) | |
| Ulli Gäher | Preußen Münster | 4 (0) | |
| Michael Hubner | Rot-Weiss Essen | 4 (0) | |
| Uwe Kober | MSV Duisburg | 4 (0) | |
| Michael Krätzer | 1. FC Saarbrücken | 4 (0) | |
| Dirk Lellek | VfL Osnabrück | 4 (0) | |
| Stanislav Levý | Blau-Weiß 90 Berlin | 4 (0) | |
| Sergio Maciel | FC 08 Homburg | 4 (0) | |
| Carsten Marquardt | VfL Osnabrück | 4 (0) | |
| Thomas Motzke | Blau-Weiß 90 Berlin | 4 (1) | |
| Paolo da Palma | VfB Oldenburg | 4 (0) | |
| Ulf-Volker Probst | Eintracht Braunschweig | 4 (0) | |
| Michael Schuhmacher | 1. FSV Mainz 05 | 4 (0) | |
| Dirk Schuster | Eintracht Braunschweig | 4 (0) | |
| Peter Seufert | Fortuna Köln | 4 (3) | |
| Dirk Spannuth | TSV Havelse | 4 (0) | |
| Karsten Surmann | Hannover 96 | 4 (3) | |
| Michael Tarnat | MSV Duisburg | 4 (0) | |
| Ralf Voigt | VfL Osnabrück | 4 (0) | |
| Roman Wójcicki | Hannover 96 | 4 (0) | |
| 93. | Jürgen Baier | SV Darmstadt 98 | 3 (3) |
| Igor Belanov | Eintracht Braunschweig | 3 (0) | |
| Detlef Dezelak | Rot-Weiss Essen | 3 (0) | |
| Egon Flad | FC Schalke 04 | 3 (0) | |
| Guido Fleige | Preußen Münster | 3 (0) | |
| Wenanty Fuhl | 1. FC Saarbrücken | 3 (0) | |
| Andreas Golombek | SC Freiburg | 3 (0) | |
| Bernd Häcker | 1. FC Schweinfurt 05 | 3 (0) | |
| Ralf Heskamp | VfL Osnabrück | 3 (0) | |
| Tobias Homp | FC 08 Homburg | 3 (0) | |
| Uwe Igler | VfL Osnabrück | 3 (0) | |
| Srdjan Jankovic | Rot-Weiss Essen | 3 (1) | |
| Frank Klobke | SV Meppen | 3 (0) | |
| Thomas Kloss | SV Darmstadt 98 | 3 (0) | |
| Thomas Knauer | Preußen Münster | 3 (0) | |
| Harald Kügler | Preußen Münster | 3 (0) | |
| Willi Landgraf | Rot-Weiss Essen | 3 (0) | |
| Ewald Lienen | MSV Duisburg | 3 (0) | |
| Frank Meyer | VfB Oldenburg | 3 (0) | |
| Radmilo Mihajlović | FC Schalke 04 | 3 (1) | |
| Andreas Müller | TSV Havelse | 3 (0) | |
| Richard Naawuh | Waldhof Mannheim | 3 (0) | |
| Michael Pfahler | SC Freiburg | 3 (0) | |
| Christiaan Pförtner | 1. FC Saarbrücken | 3 (0) | |
| Peer Posipal | Preußen Münster | 3 (1) | |
| Jürgen Röber | Rot-Weiss Essen | 3 (3) | |
| Rafael Sánchez | SV Darmstadt 98 | 3 (0) | |
| Bernd Schindler | Waldhof Mannheim | 3 (0) | |
| Hans-Jörg Schneider | Fortuna Köln | 3 (0) | |
| Adrian Spyrka | 1. FC Saarbrücken | 3 (2) | |
| Wolfgang Steinbach | VfB Oldenburg | 3 (1) | |
| Jens Todt | TSV Havelse | 3 (0) | |
| Niclas Weiland | Hannover 96 | 3 (0) | |
| Oliver Wölfling | 1. FC Schweinfurt 05 | 3 (3) | |
| Andreas Zeyer | SC Freiburg | 3 (0) | |
| 128. | Mohamed Azima | Fortuna Köln | 2 (0) |
| Dirk Bastian | FC 08 Homburg | 2 (0) | |
| Jörg Beyel | MSV Duisburg | 2 (0) | |
| Christian Claaßen | VfB Oldenburg | 2 (0) | |
| Bernd Deters | SV Meppen | 2 (0) | |
| Roland Dickgießer | Waldhof Mannheim | 2 (0) | |
| Bogdan Długajczyk | SV Meppen | 2 (0) | |
| Elmar Drenkard | 1. FC Schweinfurt 05 | 2 (0) | |
| Holger Drieling | VfB Oldenburg | 2 (0) | |
| Lars Ellmerich | VfB Oldenburg | 2 (0) | |
| Joachim Gehrmann | TSV Havelse | 2 (0) | |
| Ralf Geilenkirchen | Eintracht Braunschweig | 2 (0) | |
| Heikko Glöde | 1. FC Saarbrücken | 2 (1) | |
| Thomas Gräbener | Preußen Münster | 2 (0) | |
| Gyula Hajszán | MSV Duisburg | 2 (0) | |
| Ralf Haub | Preußen Münster | 2 (0) | |
| Bernd Heemsoth | Hannover 96 | 2 (0) | |
| Dirk Hupe | Fortuna Köln | 2 (0) | |
| Olaf Kirn | 1. FSV Mainz 05 | 2 (0) | |
| Norman Klein | 1. FSV Mainz 05 | 2 (0) | |
| Frank Kontny | Rot-Weiss Essen | 2 (0) | |
| Willi Kronhardt | TSV Havelse | 2 (0) | |
| Michael Kroninger | FC Schalke 04 | 2 (0) | |
| Dirk Kurtenbach | Fortuna Köln | 2 (0) | |
| Dirk Lottner | Fortuna Köln | 2 (0) | |
| Jürgen Luginger | FC Schalke 04 | 2 (0) | |
| Frank Möller | 1. FSV Mainz 05 | 2 (0) | |
| Andreas Müller | FC Schalke 04 | 2 (0) | |
| Jochen Müller | Waldhof Mannheim | 2 (0) | |
| Jürgen Niggemann | Fortuna Köln | 2 (0) | |
| Patrick Notthoff | MSV Duisburg | 2 (0) | |
| Roger Prinzen | SV Darmstadt 98 | 2 (0) | |
| Michael Schjønberg | Hannover 96 | 2 (0) | |
| Thomas Schmidt | Eintracht Braunschweig | 2 (0) | |
| Alfred Schön | Waldhof Mannheim | 2 (0) | |
| Oswald Semlits | VfL Osnabrück | 2 (0) | |
| Lutz Siebrecht | Waldhof Mannheim | 2 (0) | |
| Franz-Josef Steininger | MSV Duisburg | 2 (0) | |
| Reinhold Tattermusch | Stuttgarter Kickers | 2 (0) | |
| Dragan Terzić | Stuttgarter Kickers | 2 (0) | |
| Frank Thommessen | Rot-Weiss Essen | 2 (0) | |
| Stefan Tiedgen | TSV Havelse | 2 (0) | |
| Thomas Vogel | TSV Havelse | 2 (0) | |
| Achim Weber | Fortuna Köln | 2 (0) | |
| Carsten Weiß | 1. FC Schweinfurt 05 | 2 (0) | |
| Thomas Weiß | SV Darmstadt 98 | 2 (0) | |
| Ulrich Wilke | TSV Havelse | 2 (0) | |
| Christian Wörns | Waldhof Mannheim | 2 (0) | |
| 176. | Henry Acquah | Preußen Münster | 1 (0) |
| Ralf Aussem | Fortuna Köln | 1 (0) | |
| Nenad Bankovic | TSV Havelse | 1 (0) | |
| Ünsal Bayzit | Fortuna Köln | 1 (0) | |
| Michael Becker | 1. FSV Mainz 05 | 1 (0) | |
| Aaron Biagioli | 1. FSV Mainz 05 | 1 (1) | |
| Hakan Biçici | Hannover 96 | 1 (0) | |
| Claudiu Bozesan | 1. FC Schweinfurt 05 | 1 (0) | |
| Damir Bujan | Blau-Weiß 90 Berlin | 1 (0) | |
| Massimo D'Ippolito | FC 08 Homburg | 1 (0) | |
| Dietmar Drabow | Blau-Weiß 90 Berlin | 1 (0) | |
| Yves Eigenrauch | FC Schalke 04 | 1 (0) | |
| Uwe Erlebach | Rot-Weiss Essen | 1 (0) | |
| Dirk Fengler | Stuttgarter Kickers | 1 (0) | |
| Dieter Finke | FC 08 Homburg | 1 (0) | |
| Jacek Frąckiewicz | Eintracht Braunschweig | 1 (0) | |
| Peter Gartmann | Blau-Weiß 90 Berlin | 1 (0) | |
| Dirk Gellrich | VfL Osnabrück | 1 (0) | |
| Thomas Gerstner | VfB Oldenburg | 1 (0) | |
| Midhat Gluhačević | SC Freiburg | 1 (0) | |
| Bernd Gorski | Eintracht Braunschweig | 1 (0) | |
| Florian Gothe | 1. FC Saarbrücken | 1 (1) | |
| Martin Groth | Hannover 96 | 1 (0) | |
| Guangming Gu | SV Darmstadt 98 | 1 (0) | |
| Rudolf Gürtler | 1. FC Schweinfurt 05 | 1 (0) | |
| Dieter Gutzler | SV Darmstadt 98 | 1 (0) | |
| Wladislaw Hanke | VfB Oldenburg | 1 (0) | |
| Fabrizio Hayer | 1. FSV Mainz 05 | 1 (0) | |
| Steffen Herzberger | 1. FSV Mainz 05 | 1 (0) | |
| Freddy Heß | SV Darmstadt 98 | 1 (0) | |
| Krzysztof Hetmański | FC 08 Homburg | 1 (0) | |
| Gerd Heuermann | SV Meppen | 1 (0) | |
| Norbert Hofmann | Waldhof Mannheim | 1 (0) | |
| Matthias Imhof | Stuttgarter Kickers | 1 (0) | |
| Rainer Jahn | VfB Oldenburg | 1 (0) | |
| Goran Jerković | 1. FC Schweinfurt 05 | 1 (0) | |
| Krzysztof Kajrys | FC 08 Homburg | 1 (0) | |
| Frank Kirchhoff | 1. FC Saarbrücken | 1 (0) | |
| Joachim Klemenz | SC Freiburg | 1 (0) | |
| Martin Kollenberg | Preußen Münster | 1 (0) | |
| Steffen Korell | FC 08 Homburg | 1 (0) | |
| Mathias Kuhlmey | Hannover 96 | 1 (0) | |
| Holger Kühnel | VfL Osnabrück | 1 (0) | |
| Udo Lay | SC Freiburg | 1 (0) | |
| Tino Löchelt | Eintracht Braunschweig | 1 (0) | |
| Ronald Lotz | Eintracht Braunschweig | 1 (0) | |
| Goran Markov | Blau-Weiß 90 Berlin | 1 (0) | |
| Uwe Meyer | Waldhof Mannheim | 1 (0) | |
| Michael Nushöhr | 1. FC Saarbrücken | 1 (0) | |
| Hans-Uwe Pilz | Fortuna Köln | 1 (0) | |
| Jürgen Prange | TSV Havelse | 1 (0) | |
| Petr Rada | Rot-Weiss Essen | 1 (0) | |
| Dirk Römer | Preußen Münster | 1 (0) | |
| Olaf Rose | Eintracht Braunschweig | 1 (0) | |
| Werner Rusche | SV Meppen | 1 (1) | |
| Dietmar Schacht | FC Schalke 04 | 1 (0) | |
| Guido Schäfer | 1. FSV Mainz 05 | 1 (0) | |
| Heinz-Günter Scheil | Eintracht Braunschweig | 1 (0) | |
| Karl-Heinz Schulz | SC Freiburg | 1 (0) | |
| Jens Schürer | 1. FC Schweinfurt 05 | 1 (0) | |
| Wolfgang Sidka | VfB Oldenburg | 1 (0) | |
| Jörg Silberbach | Preußen Münster | 1 (0) | |
| Jörg Strube | Rot-Weiss Essen | 1 (0) | |
| Axel Sundermann | Hannover 96 | 1 (0) | |
| Jochen Terhaar | Preußen Münster | 1 (0) | |
| Klaus Theiss | FC 08 Homburg | 1 (1) | |
| Martin van der Pütten | SV Meppen | 1 (0) | |
| Dirk van der Ven | 1. FC Schweinfurt 05 | 1 (0) | |
| Thomas Winter | Stuttgarter Kickers | 1 (0) | |
| Lothar Woelk | MSV Duisburg | 1 (0) | |
| Torsten Wohlert | FC 08 Homburg | 1 (0) | |
| Thorsten Wörsdörfer | FC Schalke 04 | 1 (0) | |
| Krzysztof Zając | VfB Oldenburg | 1 (0) | |
| Thomas Zechel | FC Schalke 04 | 1 (0) | |
| Michael Zeyer | SC Freiburg | 1 (0) |
| Relegation In den Relegationsspielen trafen der FC St. Pauli (Sechzehnter der Bundesliga) und die Stuttgarter Kickers (Dritter der 2. Bundesliga) aufeinander. |
| Datum | Ergebnis | ||
| Mi 19.06., 20:15 | FC St. Pauli | 1:1 | Stuttgarter Kickers |
| So 23.06., 17:00 | Stuttgarter Kickers | 1:1 | FC St. Pauli |
| Gesamt: | FC St. Pauli | 2:2 | Stuttgarter Kickers |
| Entscheidungsspiel |
| Datum | Ergebnis | ||
| Sa 29.06., 15:30 | FC St. Pauli | 1:3 | Stuttgarter Kickers |
Aufstieg Mit Schalke und Duisburg kehrten zwei Traditionsteams in die Bundesliga zurück. Die Stuttgarter Kickers erreichten über die bis 2009 letztmals ausgetragene Relegation zum zweiten Mal in ihrer Geschichte den Aufstieg. Aufstieg zur 2. Bundesliga 1990/91 Gruppe Nord |
| Pl. | Verein | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Punkte |
| 1. | VfB Oldenburg | 8 | 5 | 2 | 1 | 19:8 | +11 | 12:4 |
| 2. | TSV Havelse | 8 | 5 | 2 | 1 | 19:15 | +4 | 12:4 |
| 3. | Arminia Bielefeld | 8 | 3 | 3 | 2 | 16:11 | +5 | 9:7 |
| 4. | Wuppertaler SV | 8 | 2 | 0 | 6 | 11:21 | −10 | 4:12 |
| 5. | Reinickendorfer Füchse | 8 | 1 | 1 | 6 | 8:18 | −10 | 3:13 |
| Gesamt | Hinspiel | Rückspiel | ||
| VfB Oldenburg | – | TSV Havelse | 5:1 | 0:0 |
| Reinickendorfer Füchse | – | Arminia Bielefeld | 1:2 | 0:0 |
| Wuppertaler SV | – | Reinickendorfer Füchse | 4:1 | 1:0 |
| Arminia Bielefeld | – | VfB Oldenburg | 2:2 | 0:2 |
| VfB Oldenburg | – | Wuppertaler SV | 3:0 | 2:1 |
| TSV Havelse | – | Arminia Bielefeld | 3:2 | 2:2 |
| Reinickendorfer Füchse | – | VfB Oldenburg | 2:1 | 2:4 |
| Wuppertaler SV | – | TSV Havelse | 2:4 | 2:3 |
| TSV Havelse | – | Reinickendorfer Füchse | 3:0 | 3:2 |
| Arminia Bielefeld | – | Wuppertaler SV | 3:0 | 5:1 |
| Gruppe Süd |
| Pl. | Verein | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Punkte |
| 1. | 1. FSV Mainz 05 | 6 | 4 | 0 | 2 | 10:6 | +4 | 8:4 |
| 2. | 1. FC Schweinfurt 05 | 6 | 3 | 2 | 1 | 7:4 | +3 | 8:4 |
| 3. | SSV Reutlingen 05 | 6 | 3 | 1 | 2 | 11:8 | +3 | 7:5 |
| 4. | Rot-Weiss Frankfurt | 6 | 0 | 1 | 5 | 3:13 | −10 | 1:11 |
| Gesamt | Hinspiel | Rückspiel | ||
| SSV Reutlingen 05 | – | 1. FSV Mainz 05 | 0:1 | 3:2 |
| 1. FC Schweinfurt 05 | – | Rot-Weiss Frankfurt | 0:0 | 2:0 |
| 1. FSV Mainz 05 | – | 1. FC Schweinfurt 05 | 2:0 | 0:1 |
| Rot-Weiss Frankfurt | – | SSV Reutlingen 05 | 1:3 | 0:3 |
| Rot-Weiss Frankfurt | – | 1. FSV Mainz 05 | 1:2 | 1:3 |
| 1. FC Schweinfurt 05 | – | SSV Reutlingen 05 | 3:1 | 1:1 |
| Abstieg Rot-Weiss Essen wurde die Lizenz entzogen. Die endgültige Entscheidung fiel erst nach Saisonende am 22. Juni. Hertha BSC erhielt hingegen in der letzten Instanz die Lizenz. Durch Essens Abstieg bleibt Darmstadt in der zweiten Liga. Darmstadt zog daraufhin seinen Protest gegen das letzte Saisonspiel in Schalke (1:0 für Schalke) zurück. Tausende Fans hatten anlässlich der Schalker Aufstiegsfeier den Platz gestürmt und verhinderten ein reguläres Spielende. Neben Essen musste Preußen Münster sowie die beiden Neulinge Havelse und Schweinfurt in die Oberliga absteigen. |
