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| # | Spieler | Land | Mannschaft | Tore (11m) |
| 1. | Marco Weißhaupt | Deutschland | Rot-Weiß Erfurt | 22 (9) |
| 2. | Ilija Aračić | Kroatien | Chemnitzer FC | 18 (0) |
| Daniel Bärwolf | Deutschland | Rot-Weiß Erfurt | 18 (0) | |
| 4. | Mike Sadlo | Deutschland | Erzgebirge Aue | 17 (0) |
| 5. | Oleg Golovan | Ukraine | Sachsen Leipzig | 16 (0) |
| 6. | Toralf Konetzke | Deutschland | Energie Cottbus | 15 (0) |
| 7. | Ronny Hebestreit | Deutschland | Rot-Weiß Erfurt | 14 (0) |
| 8. | Thomas Adler | Deutschland | TeBe Berlin | 13 (0) |
| Detlef Irrgang | Deutschland | Energie Cottbus | 13 (0) | |
| Rainer Wiedemann | Deutschland | Lok Altmark Stendal | 13 (1) | |
| 11. | Torsten Gütschow | Deutschland | Dynamo Dresden | 12 (2) |
| Rocco Milde | Deutschland | Dynamo Dresden | 12 (3) | |
| 13. | Bernd Jopek | Deutschland | Spandauer SV | 11 (1) |
| Sven Kaiser | Deutschland | Sachsen Leipzig | 11 (0) | |
| Faruk Namdar | Deutschland | Reinickendorfer Füchse | 11 (0) | |
| Rene Thieme | Deutschland | Stahl Eisenhüttenstadt | 11 (0) | |
| 17. | Michael Ballack | Deutschland | Chemnitzer FC | 10 (0) |
| Maik Eidtner | Deutschland | Spandauer SV | 10 (0) | |
| Ralf Rambow | Deutschland | Stahl Eisenhüttenstadt | 10 (6) | |
| Steven Zweigler | Deutschland | Erzgebirge Aue | 10 (0) | |
| 21. | Steffen Hammermüller | Deutschland | Sachsen Leipzig | 9 (4) |
| Frank Ludwig | Deutschland | Wacker Nordhausen | 9 (0) | |
| Silvio Schade | Deutschland | Stahl Eisenhüttenstadt | 9 (0) | |
| Andre Skerka | Deutschland | SC Charlottenburg | 9 (0) | |
| Norman Struck | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 9 (0) | |
| 26. | Sven Benken | Deutschland | Energie Cottbus | 8 (0) |
| Dirk Hempel | Deutschland | Erzgebirge Aue | 8 (0) | |
| Harun Isa | Albanien | TeBe Berlin | 8 (0) | |
| Marek Seruga | Polen | FC Berlin | 8 (0) | |
| 30. | Steffen Binke | Deutschland | VFC Plauen | 7 (4) |
| Guido Gorges | Deutschland | Wacker Nordhausen | 7 (0) | |
| Marco Küntzel | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 7 (0) | |
| Jens Melzig | Deutschland | Energie Cottbus | 7 (0) | |
| Amir Osmanović | Bosnien-Herzegowina | Chemnitzer FC | 7 (0) | |
| Frank Seifert | Deutschland | Energie Cottbus | 7 (0) | |
| Jens Starke | Deutschland | VFC Plauen | 7 (1) | |
| Andy Wagner | Deutschland | Stahl Eisenhüttenstadt | 7 (0) | |
| Jörg Weber | Deutschland | Stahl Eisenhüttenstadt | 7 (0) | |
| Andriy Zapyshnyi | Ukraine | VFC Plauen | 7 (0) | |
| 40. | Thorsten Boer | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 6 (0) |
| Mario Brömßer | Deutschland | VFC Plauen | 6 (0) | |
| Gerald Klews | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 6 (0) | |
| Denis Koslov | Russland | FSV 90 Velten | 6 (0) | |
| Dirk Kunert | Deutschland | Hertha Zehlendorf | 6 (3) | |
| Timo Lesch | Deutschland | FC Berlin | 6 (0) | |
| Dirk Muschiol | Deutschland | Reinickendorfer Füchse | 6 (3) | |
| Miran Pavlin | Slowenien | Dynamo Dresden | 6 (0) | |
| Helgi Sigurðsson | Island | TeBe Berlin | 6 (0) | |
| Michael Steiner | Deutschland | Reinickendorfer Füchse | 6 (0) | |
| Jens Wahl | Deutschland | Chemnitzer FC | 6 (3) | |
| Jan Wehrmann | Deutschland | Rot-Weiß Erfurt | 6 (1) | |
| Matthias Zimmerling | Deutschland | Energie Cottbus | 6 (0) | |
| Jens-Uwe Zöphel | Deutschland | Energie Cottbus | 6 (1) | |
| 54. | Taşkın Aksoy | Türkei | TeBe Berlin | 5 (4) |
| Sven Baum | Deutschland | Dynamo Dresden | 5 (0) | |
| Guido Block | Deutschland | TeBe Berlin | 5 (0) | |
| Ronny Dau | Deutschland | Lok Altmark Stendal | 5 (0) | |
| Jacek Frąckiewicz | Polen | TeBe Berlin | 5 (0) | |
| Holger Fraedrich | Deutschland | Energie Cottbus | 5 (0) | |
| Mayk Goschin | Deutschland | FSV 90 Velten | 5 (0) | |
| Torsten Gowitzke | Deutschland | SC Charlottenburg | 5 (1) | |
| Igor Lazic | Bosnien-Herzegowina | Dynamo Dresden | 5 (0) | |
| Axel Lorenz | Deutschland | Hertha Zehlendorf | 5 (0) | |
| Marko Rehmer | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 5 (0) | |
| Frank Schneider | Deutschland | Wacker Nordhausen | 5 (0) | |
| André Schönitz | Deutschland | Sachsen Leipzig | 5 (0) | |
| Khvicha Shubitidze | Georgien | Lok Altmark Stendal | 5 (0) | |
| 68. | Torsten Bittermann | Deutschland | Chemnitzer FC | 4 (0) |
| Jens Eisenschmidt | Deutschland | Wacker Nordhausen | 4 (0) | |
| Oliver Holzbecher | Deutschland | Reinickendorfer Füchse | 4 (0) | |
| René Kiel | Deutschland | Wacker Nordhausen | 4 (3) | |
| Björn Kremser | Deutschland | Spandauer SV | 4 (0) | |
| Roman Müller | Deutschland | FC Berlin | 4 (1) | |
| Dariusz Pasieka | Polen | Dynamo Dresden | 4 (0) | |
| Nico Patschinski | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 4 (0) | |
| Nico Scheller | Deutschland | Rot-Weiß Erfurt | 4 (0) | |
| Jan Schmidt | Deutschland | Dynamo Dresden | 4 (0) | |
| Jörg Schmidt | Deutschland | Dynamo Dresden | 4 (0) | |
| Ervin Skela | Albanien | 1. FC Union Berlin | 4 (1) | |
| Udo Tautenhahn | Deutschland | Erzgebirge Aue | 4 (4) | |
| Mirko Ullmann | Deutschland | Chemnitzer FC | 4 (0) | |
| Vidmantas Vysniauskas | Litauen | Sachsen Leipzig | 4 (0) | |
| Ulf Wiemer | Deutschland | Stahl Eisenhüttenstadt | 4 (0) | |
| Steffen Ziffert | Deutschland | Sachsen Leipzig | 4 (0) | |
| 85. | Dinalo Adigo | Benin | Lok Altmark Stendal | 3 (0) |
| Frank Bartz | Deutschland | Stahl Eisenhüttenstadt | 3 (0) | |
| Heiko Brestrich | Deutschland | FC Berlin | 3 (0) | |
| Manuel Cornelius | Deutschland | Hertha Zehlendorf | 3 (0) | |
| Steffen Dünger | Deutschland | VFC Plauen | 3 (0) | |
| Udo Fankhänel | Deutschland | Erzgebirge Aue | 3 (0) | |
| Dirk Grempler | Deutschland | Lok Altmark Stendal | 3 (0) | |
| Rico Hanke | Deutschland | Dynamo Dresden | 3 (0) | |
| Ralf Heider | Deutschland | Wacker Nordhausen | 3 (1) | |
| Mario Kallnik | Deutschland | FC Berlin | 3 (0) | |
| Celaleddin Kocak | Türkei | TeBe Berlin | 3 (0) | |
| Bozo Kolak | Kroatien | SC Charlottenburg | 3 (0) | |
| Stephan Kuhlow | Deutschland | SC Charlottenburg | 3 (0) | |
| Stefan Otto | Deutschland | Wacker Nordhausen | 3 (0) | |
| Rico Reinold | Deutschland | Erzgebirge Aue | 3 (0) | |
| Stephan Schmidt | Deutschland | Reinickendorfer Füchse | 3 (0) | |
| Arnd Spranger | Deutschland | VFC Plauen | 3 (0) | |
| Ronny Thielemann | Deutschland | Erzgebirge Aue | 3 (0) | |
| Alexander Tolmatschev | Russland | FSV 90 Velten | 3 (3) | |
| Jörg Woltmann | Deutschland | Energie Cottbus | 3 (0) | |
| 105. | Baris Avanoglu | Türkei | SC Charlottenburg | 2 (0) |
| Danny Bach | Deutschland | VFC Plauen | 2 (0) | |
| Abubaker Ben-Krema | Libyen | Sachsen Leipzig | 2 (0) | |
| Jörg Blüthmann | Deutschland | Hertha Zehlendorf | 2 (0) | |
| Rico Clemens | Deutschland | Sachsen Leipzig | 2 (0) | |
| Junuz Coralic | Bosnien-Herzegowina | TeBe Berlin | 2 (0) | |
| Yevhen Drahunov | Ukraine | Rot-Weiß Erfurt | 2 (0) | |
| Recardo Egel | Deutschland | Rot-Weiß Erfurt | 2 (0) | |
| Rock Embingou | Kongo | Lok Altmark Stendal | 2 (0) | |
| Torsten Feetz | Deutschland | Sachsen Leipzig | 2 (0) | |
| Marco Gräfe | Deutschland | Sachsen Leipzig | 2 (0) | |
| Bernd Henklein | Deutschland | Spandauer SV | 2 (0) | |
| Thomas Herbst | Deutschland | Hertha Zehlendorf | 2 (0) | |
| Markus Hoffmann | Deutschland | Lok Altmark Stendal | 2 (0) | |
| Thomas Hoßmang | Deutschland | Energie Cottbus | 2 (0) | |
| Antoni Jeleń | Polen | Dynamo Dresden | 2 (0) | |
| Kay-Uwe Jendrossek | Deutschland | Chemnitzer FC | 2 (0) | |
| Sven Köhler | Deutschland | Chemnitzer FC | 2 (0) | |
| Marcus Kolbuch | Deutschland | FSV 90 Velten | 2 (2) | |
| Sven Kretschmer | Deutschland | Reinickendorfer Füchse | 2 (0) | |
| Willi Kronhardt | Deutschland | Energie Cottbus | 2 (0) | |
| Thomas Laudeley | Deutschland | Chemnitzer FC | 2 (0) | |
| Jörn Lenz | Deutschland | TeBe Berlin | 2 (0) | |
| Jörg Leonhardt | Deutschland | Erzgebirge Aue | 2 (1) | |
| Ante Markesic | Bosnien-Herzegowina | Dynamo Dresden | 2 (0) | |
| Sven Meyer | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 2 (0) | |
| Zoran Milinkovic | Serbien | FSV 90 Velten | 2 (0) | |
| Igor Momirovski | Nordmazedonien | TeBe Berlin | 2 (0) | |
| Stephan Nevoigt | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 2 (0) | |
| Dariusz Pater | Polen | SC Charlottenburg | 2 (0) | |
| Matthias Plack | Deutschland | SC Charlottenburg | 2 (0) | |
| Mikhail Pronichev | Russland | FC Berlin | 2 (0) | |
| Dirk Rettig | Deutschland | Energie Cottbus | 2 (0) | |
| Heiko Riedel | Deutschland | VFC Plauen | 2 (0) | |
| Carsten Romanowsky | Deutschland | Erzgebirge Aue | 2 (0) | |
| Sven Schmelzer | Deutschland | Spandauer SV | 2 (0) | |
| Axel Schröter | Deutschland | VFC Plauen | 2 (0) | |
| Michael Stahr | Deutschland | SC Charlottenburg | 2 (0) | |
| Falk Terjek | Deutschland | Dynamo Dresden | 2 (0) | |
| André Tews | Deutschland | Rot-Weiß Erfurt | 2 (0) | |
| Andreas Thurau | Deutschland | Hertha Zehlendorf | 2 (0) | |
| Antal Topor | Ungarn | Lok Altmark Stendal | 2 (0) | |
| Mario Weiß | Deutschland | VFC Plauen | 2 (0) | |
| Mirko Wüstemann | Deutschland | Hertha Zehlendorf | 2 (0) | |
| Tino Zock | Deutschland | FSV 90 Velten | 2 (0) | |
| 150. | André Bandit | Deutschland | Reinickendorfer Füchse | 1 (0) |
| Marcelo Bellomo | Deutschland | Reinickendorfer Füchse | 1 (0) | |
| Henry Berg | Deutschland | Erzgebirge Aue | 1 (0) | |
| Sven Bergen | Deutschland | Lok Altmark Stendal | 1 (0) | |
| Hartmut Berndt | Deutschland | FSV 90 Velten | 1 (0) | |
| Vedat Beyazit | Türkei | Reinickendorfer Füchse | 1 (0) | |
| Rene Bley | Deutschland | Erzgebirge Aue | 1 (0) | |
| Müslim Can | Türkei | Reinickendorfer Füchse | 1 (0) | |
| Almedin Civa | Bosnien-Herzegowina | Reinickendorfer Füchse | 1 (0) | |
| Thomas Dahlke | Deutschland | FC Berlin | 1 (0) | |
| Zafer Demiray | Türkei | Reinickendorfer Füchse | 1 (0) | |
| Jan Dohrwardt | Deutschland | Hertha Zehlendorf | 1 (0) | |
| Mike Frank | Deutschland | Reinickendorfer Füchse | 1 (0) | |
| Ayhan Gezen | Deutschland | FC Berlin | 1 (0) | |
| Jens Große | Deutschland | Rot-Weiß Erfurt | 1 (0) | |
| Marko Große | Deutschland | Wacker Nordhausen | 1 (0) | |
| Ivica Gvozden | Bosnien-Herzegowina | Chemnitzer FC | 1 (0) | |
| Dirk Hannemann | Deutschland | TeBe Berlin | 1 (0) | |
| Miroslav Jagatic | Deutschland | Spandauer SV | 1 (0) | |
| Ronny Jank | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 1 (0) | |
| Frank Kaiser | Deutschland | Dynamo Dresden | 1 (0) | |
| Mario Kern | Deutschland | Dynamo Dresden | 1 (0) | |
| Stefan Kirsten | Deutschland | Dynamo Dresden | 1 (0) | |
| Stephan Korsch | Deutschland | FSV 90 Velten | 1 (0) | |
| André Krasselt | Deutschland | Chemnitzer FC | 1 (0) | |
| Holger Krauß | Deutschland | Sachsen Leipzig | 1 (0) | |
| René Laschzok | Deutschland | Stahl Eisenhüttenstadt | 1 (0) | |
| Jens Ludwig | Deutschland | Wacker Nordhausen | 1 (0) | |
| Bernd Maier | Deutschland | Spandauer SV | 1 (0) | |
| Marco Meldau | Deutschland | Wacker Nordhausen | 1 (0) | |
| Steffen Milenz | Deutschland | SC Charlottenburg | 1 (0) | |
| Gert Müller | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 1 (0) | |
| Mario Neuhäuser | Deutschland | Chemnitzer FC | 1 (0) | |
| Jörg Niederhübner | Deutschland | Spandauer SV | 1 (0) | |
| Heiko Nowak | Deutschland | Rot-Weiß Erfurt | 1 (0) | |
| Daniel Papst | Deutschland | Wacker Nordhausen | 1 (0) | |
| Tom Persich | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 1 (0) | |
| Daniel Petrowsky | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 1 (0) | |
| Torsten Petzold | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 1 (0) | |
| Frank Placzek | Deutschland | 1. FC Union Berlin | 1 (0) | |
| Jens Reckmann | Deutschland | FC Berlin | 1 (0) | |
| Frank Rietschel | Deutschland | Sachsen Leipzig | 1 (0) | |
| Andrej Rosljakow | Ukraine | Rot-Weiß Erfurt | 1 (0) | |
| Karsten Scharnitzky | Deutschland | Wacker Nordhausen | 1 (0) | |
| Dirk Schlegel | Deutschland | FSV 90 Velten | 1 (0) | |
| Andreas Schmidt | Deutschland | Lok Altmark Stendal | 1 (0) | |
| Hagen Schmidt | Deutschland | Wacker Nordhausen | 1 (0) | |
| Ingolf Schneider | Deutschland | Energie Cottbus | 1 (0) | |
| Jörn Schulz | Deutschland | Lok Altmark Stendal | 1 (0) | |
| Thomas Schwöbel | Deutschland | Stahl Eisenhüttenstadt | 1 (1) | |
| Matthias Senger | Deutschland | FSV 90 Velten | 1 (0) | |
| Maik Soschinski | Deutschland | VFC Plauen | 1 (0) | |
| Jens Stupning | Deutschland | VFC Plauen | 1 (0) | |
| Alexander Tetzner | Deutschland | Chemnitzer FC | 1 (0) | |
| Borislav Tomoski | Nordmazedonien | Erzgebirge Aue | 1 (0) | |
| Abdulkadir Unutkan | Türkei | Spandauer SV | 1 (0) | |
| Detlef Weichmann | Deutschland | FSV 90 Velten | 1 (0) | |
| Mike Wenzel | Deutschland | Hertha Zehlendorf | 1 (1) | |
| René Wenzel | Deutschland | Stahl Eisenhüttenstadt | 1 (0) | |
| Thomas Wolfrum | Deutschland | VFC Plauen | 1 (0) | |
| Cemal Yildiz | Türkei | Hertha Zehlendorf | 1 (0) |
