| Datum | Anstoß | Ergebnis | |||
| 08.09.2006 | 19:00 | SV Sandhausen | - | SpVgg Greuther Fürth | 0:2 (0:1) |
| 19:00 | VfL Osnabrück | - | Eintracht Braunschweig | 3:1 (0:0) | |
| 09.09.2006 | 14:00 | Westfalia Herne | - | Erzgebirge Aue | 1:2 (0:0) |
| 14:00 | 1. FC Magdeburg | - | SC Paderborn 07 | 6:7 (0:0, 1:1, 1:1) i.E. | |
| 14:30 | SpVgg Bayreuth | - | Kickers Offenbach | 0:2 (0:2) | |
| 14:30 | TeBe Berlin | - | Karlsruher SC | 1:3 (0:2) | |
| 15:00 | Dynamo Dresden | - | Hannover 96 | 2:3 (0:2) | |
| 15:30 | Hansa Rostock II | - | FC Schalke 04 | 1:9 (0:5) | |
| 15:30 | TSG Thannhausen | - | Borussia Dortmund | 0:3 (0:3) | |
| 15:30 | FK Pirmasens | - | Werder Bremen | 4:2 (0:0, 1:1, 1:1) i.E. | |
| 15:30 | BV Cloppenburg | - | 1. FC Nürnberg | 0:1 (0:0) | |
| 15:30 | Stuttgarter Kickers | - | Hamburger SV | 4:3 (2:3, 3:3) n.V. | |
| 15:30 | Delbrücker SC | - | SC Freiburg | 2:4 (0:1) | |
| 15:30 | 1. FC Gera 03 | - | 1. FC Kaiserslautern | 0:2 (0:1) | |
| 15:30 | Rot-Weiss Essen | - | Energie Cottbus | 1:0 (0:0) | |
| 15:30 | TuS Koblenz | - | Bayer Leverkusen | 1:3 (0:0, 1:1, 2:2) i.E. | |
| 18:00 | FC Augsburg | - | Wacker Burghausen | 3:4 (0:1, 3:3) n.V. | |
| 18:30 | Alemannia Aachen II | - | VfB Stuttgart | 0:4 (0:1) | |
| 18:30 | FC 08 Homburg | - | VfL Bochum | 1:2 (0:1) | |
| 18:30 | Sportfreunde Siegen | - | Eintracht Frankfurt | 0:2 (0:1) | |
| 20:15 | FC St. Pauli | - | Bayern München | 1:2 (1:0, 1:1) n.V. | |
| 10.09.2006 | 15:00 | SV Roßbach | - | Bor. Mönchengladbach | 1:4 (0:3) |
| 15:00 | Rot Weiss Ahlen | - | MSV Duisburg | 1:2 (1:1) | |
| 15:00 | SSVg Velbert | - | SpVgg Unterhaching | 0:3 (0:1) | |
| 15:00 | SV Babelsberg 03 | - | Hansa Rostock | 2:1 (1:0) | |
| 15:00 | VfB Lübeck | - | TSV 1860 München | 1:0 (1:0) | |
| 15:00 | FC Carl Zeiss Jena | - | 1. FC Köln | 1:2 (0:2) | |
| 15:30 | FC Bremerhaven | - | VfL Wolfsburg | 1:3 (1:1) | |
| 17:00 | 1. FC Saarbrücken | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:0 (1:0) | |
| 17:00 | Chemnitzer FC | - | Alemannia Aachen | 0:2 (0:2) | |
| 17:00 | SV Darmstadt 98 | - | Hertha BSC | 0:1 (0:0, 0:0) n.V. | |
| 17:00 | SC Pfullendorf | - | Arminia Bielefeld | 2:1 (0:0) |
| Datum | Anstoß | Ergebnis | |||
| 24.10.2006 | 19:15 | SV Babelsberg 03 | - | VfB Stuttgart | 2:4 (0:1) |
| 19:30 | 1. FC Saarbrücken | - | SpVgg Greuther Fürth | 0:2 (0:1) | |
| 19:30 | FK Pirmasens | - | SpVgg Unterhaching | 0:3 (0:2) | |
| 19:30 | VfB Lübeck | - | Wacker Burghausen | 4:5 (0:0, 0:0, 0:0) i.E. | |
| 19:30 | VfL Bochum | - | Karlsruher SC | 3:2 (2:1) | |
| 19:30 | VfL Wolfsburg | - | SC Freiburg | 1:0 (0:0) | |
| 19:30 | Borussia Dortmund | - | Hannover 96 | 0:1 (0:0) | |
| 20:30 | 1. FC Köln | - | FC Schalke 04 | 4:2 (2:0, 2:2) n.V. | |
| 25.10.2006 | 19:00 | Alemannia Aachen | - | Erzgebirge Aue | 4:2 (2:1, 2:2) n.V. |
| 19:30 | SC Pfullendorf | - | Kickers Offenbach | 0:2 (0:1) | |
| 19:30 | VfL Osnabrück | - | Bor. Mönchengladbach | 2:1 (1:1) | |
| 19:30 | SC Paderborn 07 | - | 1. FC Nürnberg | 1:2 (0:0, 1:1) n.V. | |
| 19:30 | Rot-Weiss Essen | - | Eintracht Frankfurt | 1:2 (0:2) | |
| 19:30 | MSV Duisburg | - | Bayer Leverkusen | 3:2 (2:1, 2:2) n.V. | |
| 20:00 | Stuttgarter Kickers | - | Hertha BSC | abgebr. | |
| 20:30 | Bayern München | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:0 (0:0) |
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| # | Spieler | Land | Mannschaft | Tore (11m) |
| 1. | Cacau | Deutschland | VfB Stuttgart | 5 (0) |
| 2. | Diego Klimowicz | Argentinien | VfL Wolfsburg | 4 (0) |
| Naohiro Takahara | Japan | Eintracht Frankfurt | 4 (0) | |
| 4. | Roda Antar | Libanon | SC Freiburg | 3 (0) |
| Adil Chihi | Marokko | 1. FC Köln | 3 (0) | |
| Thomas Hitzlsperger | Deutschland | VfB Stuttgart | 3 (0) | |
| Michal Kolomazník | Tschechien | SpVgg Unterhaching | 3 (0) | |
| Addy Menga | DR Kongo | VfL Osnabrück | 3 (0) | |
| Laurentiu Reghecampf | Rumänien | Alemannia Aachen | 3 (1) | |
| 10. | Gerald Asamoah | Deutschland | FC Schalke 04 | 2 (0) |
| Yıldıray Baştürk | Türkei | Hertha BSC | 2 (1) | |
| Aymen Ben-Hatira | Tunesien | SV Babelsberg 03 | 2 (0) | |
| Marius Ebbers | Deutschland | Alemannia Aachen | 2 (0) | |
| Marco Engelhardt | Deutschland | 1. FC Nürnberg | 2 (0) | |
| Theofanis Gekas | Griechenland | VfL Bochum | 2 (0) | |
| Christian Giménez | Argentinien | Hertha BSC | 2 (0) | |
| Mario Gómez | Deutschland | VfB Stuttgart | 2 (0) | |
| Roberto Hilbert | Deutschland | VfB Stuttgart | 2 (0) | |
| Kevin Kurányi | Deutschland | FC Schalke 04 | 2 (0) | |
| Lincoln | Brasilien | FC Schalke 04 | 2 (0) | |
| Marek Mintál | Slowakei | 1. FC Nürnberg | 2 (0) | |
| Christian Okpala | Nigeria | Stuttgarter Kickers | 2 (1) | |
| Lukas Podolski | Deutschland | Bayern München | 2 (0) | |
| Massimilian Porcello | Deutschland | Karlsruher SC | 2 (0) | |
| Stefan Reisinger | Deutschland | SpVgg Greuther Fürth | 2 (0) | |
| Sascha Rösler | Deutschland | Alemannia Aachen | 2 (0) | |
| Jan Schlaudraff | Deutschland | Alemannia Aachen | 2 (0) | |
| David Siradze | Georgien | Erzgebirge Aue | 2 (0) | |
| Václav Svěrkoš | Tschechien | Bor. Mönchengladbach | 2 (0) | |
| Marco Vorbeck | Deutschland | Dynamo Dresden | 2 (0) | |
| Recep Yildiz | Türkei | Stuttgarter Kickers | 2 (0) | |
| 32. | Stefan Aigner | Deutschland | Wacker Burghausen | 1 (0) |
| Halil Altintop | Türkei | FC Schalke 04 | 1 (0) | |
| Ioannis Amanatidis | Griechenland | Eintracht Frankfurt | 1 (0) | |
| Antônio da Silva | Brasilien | VfB Stuttgart | 1 (0) | |
| Bilal Aziz | Libanon | VfL Osnabrück | 1 (1) | |
| Hanno Balitsch | Deutschland | Hannover 96 | 1 (0) | |
| Musemestre Bamba | Kongo | Rot Weiss Ahlen | 1 (0) | |
| Ivica Banović | Kroatien | 1. FC Nürnberg | 1 (0) | |
| Tranquillo Barnetta | Schweiz | Bayer Leverkusen | 1 (0) | |
| Tommy Bechmann | Dänemark | VfL Bochum | 1 (0) | |
| Daniel Bierofka | Deutschland | VfB Stuttgart | 1 (0) | |
| Bordon | Brasilien | FC Schalke 04 | 1 (0) | |
| Thomas Brdaric | Deutschland | Hannover 96 | 1 (0) | |
| Thomas Broich | Deutschland | 1. FC Köln | 1 (0) | |
| Thomas Bröker | Deutschland | SC Paderborn 07 | 1 (0) | |
| Arnold Bruggink | Niederlande | Hannover 96 | 1 (0) | |
| Thorsten Burkhardt | Deutschland | Wacker Burghausen | 1 (0) | |
| Heiko Butscher | Deutschland | VfL Bochum | 1 (0) | |
| Olivier Caillas | Deutschland | SpVgg Greuther Fürth | 1 (0) | |
| Guerino Capretti | Deutschland | Delbrücker SC | 1 (0) | |
| Bradley Carnell | Südafrika | Karlsruher SC | 1 (0) | |
| Thomas Cichon | Deutschland | VfL Osnabrück | 1 (1) | |
| Soumaila Coulibaly | Mali | SC Freiburg | 1 (0) | |
| Bruno Custos | Frankreich | SpVgg Unterhaching | 1 (0) | |
| Matthieu Delpierre | Frankreich | VfB Stuttgart | 1 (0) | |
| Michael Delura | Deutschland | Bor. Mönchengladbach | 1 (0) | |
| Guy Demel | Elfenbeinküste | Hamburger SV | 1 (0) | |
| Momo Diabang | Sénégal | FC Augsburg | 1 (0) | |
| Hüzeyfe Dogan | Deutschland | SC Paderborn 07 | 1 (0) | |
| Régis Dorn | Frankreich | Kickers Offenbach | 1 (0) | |
| Thomas Drescher | Deutschland | Wacker Burghausen | 1 (0) | |
| Mario Eggimann | Schweiz | Karlsruher SC | 1 (0) | |
| Sami El-Nounou | Deutschland | Westfalia Herne | 1 (0) | |
| Elton da Costa | Brasilien | FC Augsburg | 1 (0) | |
| Malik Fathi | Deutschland | Hertha BSC | 1 (0) | |
| Michael Fink | Deutschland | Eintracht Frankfurt | 1 (0) | |
| Robert Franke | Deutschland | Hansa Rostock II | 1 (0) | |
| Alexander Frei | Schweiz | Borussia Dortmund | 1 (0) | |
| Danny Fuchs | Deutschland | SpVgg Greuther Fürth | 1 (0) | |
| Michael Fuß | Deutschland | TeBe Berlin | 1 (1) | |
| Tomáš Galásek | Tschechien | 1. FC Nürnberg | 1 (0) | |
| Ivica Grlić | Bosnien-Herzegowina | MSV Duisburg | 1 (0) | |
| Charles Haffner | Frankreich | 1. FC Saarbrücken | 1 (0) | |
| Patrick Hagg | Deutschland | SC Pfullendorf | 1 (0) | |
| Tamás Hajnal | Ungarn | 1. FC Kaiserslautern | 1 (0) | |
| Mike Hanke | Deutschland | VfL Wolfsburg | 1 (0) | |
| Vahid Hashemian | Iran | Hannover 96 | 1 (0) | |
| Holger Hasse | Deutschland | FC Carl Zeiss Jena | 1 (0) | |
| Nico Herzig | Deutschland | Alemannia Aachen | 1 (0) | |
| Dustin Heun | Deutschland | VfB Lübeck | 1 (0) | |
| Kevin Hofland | Niederlande | VfL Wolfsburg | 1 (1) | |
| Rick Hoogendorp | Niederlande | VfL Wolfsburg | 1 (0) | |
| Szabolcs Huszti | Ungarn | Hannover 96 | 1 (0) | |
| Mohamadou Idrissou | Kamerun | MSV Duisburg | 1 (0) | |
| Juan | Brasilien | Bayer Leverkusen | 1 (0) | |
| Andrzej Juskowiak | Polen | Erzgebirge Aue | 1 (0) | |
| Edmond Kapllani | Albanien | Karlsruher SC | 1 (0) | |
| Azar Karadaş | Norwegen | 1. FC Kaiserslautern | 1 (0) | |
| Ivan Klasnić | Kroatien | Werder Bremen | 1 (0) | |
| Martin Köhns | Deutschland | SV Roßbach | 1 (0) | |
| Markus Kreuz | Deutschland | Kickers Offenbach | 1 (0) | |
| Jan Kristiansen | Dänemark | 1. FC Nürnberg | 1 (0) | |
| Jacek Krzynówek | Polen | VfL Wolfsburg | 1 (0) | |
| Sven Kubis | Deutschland | 1. FC Magdeburg | 1 (0) | |
| Ansgar Kuhn | Deutschland | Delbrücker SC | 1 (0) | |
| Ahmet Kuru | Türkei | Eintracht Braunschweig | 1 (1) | |
| Sotirios Kyrgiakos | Griechenland | Eintracht Frankfurt | 1 (0) | |
| Klemen Lavrič | Slowenien | MSV Duisburg | 1 (0) | |
| Robert Lechleiter | Deutschland | SpVgg Unterhaching | 1 (0) | |
| Danijel Ljuboja | Serbien | Hamburger SV | 1 (0) | |
| Alexander Löbe | Deutschland | Rot-Weiss Essen | 1 (0) | |
| Stefan Lorenz | Deutschland | Rot-Weiss Essen | 1 (0) | |
| Peter Løvenkrands | Dänemark | FC Schalke 04 | 1 (0) | |
| Ivica Lucic | Österreich | SC Pfullendorf | 1 (0) | |
| Peter Madsen | Dänemark | 1. FC Köln | 1 (0) | |
| Marcelinho | Brasilien | VfL Wolfsburg | 1 (0) | |
| Alexander Meier | Deutschland | Eintracht Frankfurt | 1 (0) | |
| Zvjezdan Misimović | Bosnien-Herzegowina | VfL Bochum | 1 (1) | |
| Youssef Mokhtari | Marokko | MSV Duisburg | 1 (0) | |
| Patrick Moritz | Deutschland | SV Babelsberg 03 | 1 (0) | |
| Lars Müller | Deutschland | FC Augsburg | 1 (0) | |
| Jan Mutschler | Deutschland | SV Babelsberg 03 | 1 (0) | |
| Marcel Ndjeng | Kamerun | Arminia Bielefeld | 1 (0) | |
| Evangelos Nessos | Griechenland | TuS Koblenz | 1 (0) | |
| Maximilian Nicu | Rumänien | Wacker Burghausen | 1 (0) | |
| Milivoje Novakovič | Slowenien | 1. FC Köln | 1 (0) | |
| Solomon Okoronkwo | Nigeria | Hertha BSC | 1 (0) | |
| Andreas Ottl | Deutschland | Bayern München | 1 (0) | |
| Chhunly Pagenburg | Kambodscha | 1. FC Nürnberg | 1 (0) | |
| Pável Pardo | Mexiko | VfB Stuttgart | 1 (1) | |
| Michael Petri | Deutschland | FC 08 Homburg | 1 (0) | |
| Dario Rodríguez | Uruguay | FC Schalke 04 | 1 (0) | |
| Simon Rolfes | Deutschland | Bayer Leverkusen | 1 (0) | |
| Ivan Saenko | Russland | 1. FC Nürnberg | 1 (0) | |
| Kenan Şahin | Türkei | TuS Koblenz | 1 (0) | |
| Yusuf Şahin | Deutschland | FC Bremerhaven | 1 (0) | |
| Boubacar Sanogo | Elfenbeinküste | Hamburger SV | 1 (0) | |
| Mitja Schäfer | Deutschland | Erzgebirge Aue | 1 (0) | |
| Bernd Schneider | Deutschland | Bayer Leverkusen | 1 (0) | |
| Timo Schultz | Deutschland | FC St. Pauli | 1 (0) | |
| Stephan Sieger | Deutschland | Kickers Offenbach | 1 (0) | |
| Wesley Sonck | Belgien | Bor. Mönchengladbach | 1 (0) | |
| Mirosław Spizak | Polen | SpVgg Unterhaching | 1 (0) | |
| Albert Streit | Deutschland | Eintracht Frankfurt | 1 (0) | |
| Tinga | Brasilien | Borussia Dortmund | 1 (0) | |
| Jon Dahl Tomasson | Dänemark | VfB Stuttgart | 1 (1) | |
| Dino Toppmöller | Deutschland | Kickers Offenbach | 1 (0) | |
| Suat Türker | Türkei | Kickers Offenbach | 1 (0) | |
| Nelson Valdez | Paraguay | Borussia Dortmund | 1 (0) | |
| Mark van Bommel | Niederlande | Bayern München | 1 (0) | |
| Gustavo Varela | Uruguay | FC Schalke 04 | 1 (0) | |
| Róbert Vittek | Slowakei | 1. FC Nürnberg | 1 (0) | |
| Hrvoje Vuković | Kroatien | Wacker Burghausen | 1 (0) | |
| Markus Weissenberger | Österreich | Eintracht Frankfurt | 1 (0) | |
| Thomas Wörle | Deutschland | Kickers Offenbach | 1 (0) | |
| Zafer Yelen | Türkei | Hansa Rostock, Hansa Rostock II | 1 (0) | |
| Zé António | Portugal | Bor. Mönchengladbach | 1 (0) | |
| Tobias Zellner | Deutschland | FK Pirmasens | 1 (0) |
