| 1 | 16.08.1996 20:00 | FC St. Pauli |
– |  FC Bayern München |
1 : 2 | |
| 2 | 20.08.1996 20:00 | Arminia Bielefeld |
– | FC St. Pauli |
1 : 2 | |
| 3 | 23.08.1996 20:00 | FC St. Pauli |
– |  FC Schalke 04 |
4 : 4 | |
| 4 | 28.08.1996 19:30 | Karlsruher SC |
– | FC St. Pauli |
4 : 0 | |
| 5 | 07.09.1996 15:30 | FC St. Pauli |
– |  SV Werder Bremen |
0 : 3 | |
| 6 | 15.09.1996 18:00 | Hamburger SV |
– | FC St. Pauli |
3 : 0 | |
| 7 | 21.09.1996 15:30 | FC St. Pauli |
– |  1. FC Köln |
0 : 0 | |
| 8 | 29.09.1996 18:00 | Borussia Dortmund |
– | FC St. Pauli |
2 : 1 | |
| 9 | 05.10.1996 15:30 | FC St. Pauli |
– |  Fortuna Düsseldorf |
3 : 0 | |
| 10 | 11.10.1996 19:30 | TSV 1860 München |
– | FC St. Pauli |
4 : 2 | |
| 11 | 19.10.1996 15:30 | FC St. Pauli |
– |  SC Freiburg |
2 : 0 | |
| 12 | 25.10.1996 20:00 | FC Hansa Rostock |
– | FC St. Pauli |
3 : 1 | |
| 13 | 02.11.1996 15:30 | FC St. Pauli |
– |  VfB Stuttgart |
2 : 1 | |
| 14 | 15.11.1996 20:00 | Borussia Mönchengladbach |
– | FC St. Pauli |
0 : 0 | |
| 15 | 23.11.1996 15:30 | FC St. Pauli |
– |  Bayer 04 Leverkusen |
3 : 1 | |
| 16 | 09.04.1997 20:00 | FC St. Pauli |
– |  VfL Bochum |
2 : 1 | |
| 17 | 07.12.1996 14:30 | MSV Duisburg |
– | FC St. Pauli |
1 : 0 | |
| 18 | 15.02.1997 15:30 | FC Bayern München |
– | FC St. Pauli |
3 : 0 | |
| 19 | 21.02.1997 20:00 | FC St. Pauli |
– | Arminia Bielefeld |
2 : 3 | |
| 20 | 28.02.1997 20:00 | FC Schalke 04 |
– | FC St. Pauli |
0 : 0 | |
| 21 | 08.03.1997 15:30 | FC St. Pauli |
– | Karlsruher SC |
2 : 4 | |
| 22 | 11.03.1997 19:30 | SV Werder Bremen |
– | FC St. Pauli |
2 : 1 | |
| 23 | 14.03.1997 20:00 | FC St. Pauli |
– | Hamburger SV |
2 : 2 | |
| 24 | 22.03.1997 15:30 | 1. FC Köln |
– | FC St. Pauli |
0 : 1 | |
| 25 | 27.03.1997 19:30 | FC St. Pauli |
– | Borussia Dortmund |
0 : 1 | |
| 26 | 05.04.1997 15:30 | Fortuna Düsseldorf |
– | FC St. Pauli |
2 : 0 | |
| 27 | 12.04.1997 15:30 | FC St. Pauli |
– | TSV 1860 München |
0 : 0 | |
| 28 | 19.04.1997 15:30 | SC Freiburg |
– | FC St. Pauli |
4 : 0 | |
| 29 | 25.04.1997 20:00 | FC St. Pauli |
– | FC Hansa Rostock |
0 : 1 | |
| 30 | 03.05.1997 15:30 | VfB Stuttgart |
– | FC St. Pauli |
3 : 0 | |
| 31 | 10.05.1997 15:30 | FC St. Pauli |
– | Borussia Mönchengladbach |
1 : 3 | |
| 32 | 17.05.1997 15:30 | Bayer 04 Leverkusen |
– | FC St. Pauli |
3 : 0 | |
| 33 | 24.05.1997 15:30 | VfL Bochum |
– | FC St. Pauli |
6 : 0 | |
| 34 | 31.05.1997 15:30 | FC St. Pauli |
– | MSV Duisburg |
0 : 2 |